1965年，中國和印度尼西亞高層互訪頻繁，各類團組往來如織。國慶期間集聚北京的印尼大小團組28個共500多人，創歷年中、印尼人員往來之最，在當時我國的對外關係中也少見。誰也沒想到這「繁華」背後，竟暗藏著外交危機。

　　禍起「九卅事件」

　　1965年9月30日午夜，以印尼總統警衛部隊查克拉比拉瓦營營長翁東中校為首的親蘇加諾軍官，在印尼共產黨的支持與配合下，以陸軍中有個「將領委員會」在首都大量集結兵力、陰謀發動推翻蘇加諾總統的軍事政變為由，在雅加達逮捕和處死了包括陸軍司令亞尼在內的六名陸軍將領和一名軍官。蘇加諾的政敵、國防安全統籌部長納蘇蒂安本是逮捕名單的頭名，則僥倖逃脫，其幼女被誤殺。這就是60年代世人皆知的印尼「九卅事件」。

　　這一突發事件，給了以納蘇蒂安為首的軍人集團公開反共的口實，引發起大規模鎮壓共產黨的行動。10月1日，時任戰略後備司令部司令的陸軍少將蘇哈托調動大量兵力控制了首都雅加達，全城通宵戒嚴，軍、憲密佈，陸軍控制的報紙和電台發動宣傳攻勢，就「九卅事件」中處死6名陸軍將領事極力煽惑。在陸軍當局控制下的雅加達一些政黨團體，也公開指責印尼共產黨是「九卅事件」的主謀。10月2日，印尼共中央機關報《人民日報》及《忠誠報》被禁止發行。10月3日，印尼國家通訊社《安塔拉》被封，旋被軍管。10月8日至10日，印尼共、人民青年團、全印尼中央職工會和印尼婦女運動協會等的總部辦公處相繼被搗毀。10月18日，雅加達軍區司令部宣佈取締上述組織和其他一些進步團體。在幾個月內，印尼共和進步團體受到嚴重摧殘，其主要領導人艾地等人全部被殺。據不完全統計，先後有20萬人慘遭殺戮，約30萬人被逮捕監禁。

　　大造反華輿論

　　與此同時，軍人集團一方面逼壓蘇加諾總統逐步讓權，一方面不斷通過媒體誣蔑中國支持「九卅運動」、干涉印尼內政，煽動反華情緒。1965年10月6日，陸軍的《戰鬥報》含沙射影地說：「難道九卅運動僅出自翁東的想法，而沒有作為幕後主使者的國內或國外的政治活動家的參與謀劃嗎？難道『九卅運動』的反革命冒險僅靠他們各自的物質力量，而沒有國內或國外廣大階層在物質和精神上的支持和幫助嗎？」《武裝部隊報》10月10日則別有用心地說，「為何『九卅運動』選擇10月1日，正好是中華人民共和國國慶日，作為民族悲劇的開端」。在大造反華輿論的同時，印尼還利用「掛旗問題」大做文章。10月5日，納蘇蒂安下令全國和駐印尼的外交使團降半旗一周，為被殺將領致哀。中國使領館堅決拒絕。但為避免刺激右派勢力，根據國內指示此間不掛旗。印尼軍人集團借題發揮，橫加指責，說中國使領館的做法「傷害了印尼的民族感情」。印尼伊斯蘭教聯合會的《社會使者報》10月7日煽惑說：「在雅加達全市，包括外國使館都下半旗，惟獨中國大使館沒有下半旗……難道沒有外國的手參加搗亂。」10月8日，印尼反華勢力煽惑群眾向我駐雅加達總領事館示威。1965年10月16日下午，40餘名全副武裝的軍人，突然包圍了中國大使館商務參贊處。他們用槍威逼中國外交人員，逐一搜身盤問，並用刺刀劈開辦公室的箱櫃，搜查文件，搶劫財務。製造了外交史上罕見的惡劣事端。