盜案發生後，溥儀派載澤、耆齡、寶熙等人到東陵對慈禧的遺體進行了重新安葬。載澤等人鑽進地宮，見慈禧遺體趴在棺蓋上，頭朝北，腳朝南，左手反搭在後背上。在地宮裡已暴屍40多天，遺體上出現了許多斑點，長滿了白毛。

慈禧不僅在生前有許多奇特的經歷，而且在她死後還有更令人難以置信的遭遇：慈禧的遺體在長達76年的時間裡，先後三次殮入同一口棺內，遺體至今仍保存完整。

第一次入棺：1908年死後第二天慈禧被殮入棺

光緒三十四年（1908年）十月二十二日未時三刻，慈禧走完了她74年的人生路程，撒手人寰。第二天上午，在隆裕皇太后和瑾妃的敬視下，慈禧的遺體被殮入了棺內。宣統元年（1909年）十月初四日巳時，慈禧的梓宮葬入菩陀峪定東陵地宮。

第二次入棺：1928年遭盜墓拋屍全身長滿白毛

慈禧死後20年，即1928年7月4日至10日。軍閥孫殿英盜掘了乾隆帝的裕陵和慈禧陵，毀棺拋屍，掠走了全部隨葬珍寶。盜案發生後，溥儀派載澤、耆齡、寶熙等人到東陵對慈禧的遺體進行了重新安葬。載澤等人鑽進地宮，見慈禧遺體趴在棺蓋上，頭朝北，腳朝南，左手反搭在後背上。在地宮裡已暴屍40多天，遺體上出現了許多斑點，長滿了白毛。

載澤等人見內棺尚完好，可以繼續使用，於是命旗婦用一塊黃綢子將慈禧遺體蓋上。眾人幫扶著，用如意板將慈禧遺體抬入棺內。遺體上蓋上一件黃緞被，載澤又將當年得到的慈禧遺物———一件黃緞袍、一件坎肩蓋在被上，蓋上棺蓋，用漆封上棺口，重殮完畢。

第三次入棺：1984年文物局清理內棺搬出屍體

1983年12月初，清東陵保管所領導決定清理慈禧內棺。1984年1月4日，國家文物局派來了幾名專家，與清東陵文物保管所組成了一個清理慈禧內棺10人小組。

清理小組將遺體從棺中抬出，在棺內噴灑了防腐消毒藥液後，又將慈禧的遺體抬入棺內。這是她死後第三次被抬入這口棺中。一切都恢復了原狀後，又往棺內噴灑了一遍藥液，蓋上棺蓋，封好棺蓋口，木工們將殘破的外槨修好後，套在了棺外。

如今，慈禧的遺體仍完整地躺在棺木內，保留著1928年第二次入殮時的原樣。