1942年8月，「保衛中國同盟」中央委員會(以下簡稱「保盟」)在重慶重新建立，宋慶齡仍然擔任主席，委員有愛潑斯坦、王安娜、廖夢醒、約翰·福斯特等人。保盟的辦公地點設在宋慶齡的寓所——兩路口新村3號。

　　在重慶的保盟首先設法和國外援華團體及友好人士重新取得聯繫，以爭取他們繼續援助保盟。很快，美國援華會、英國中國運動委員會、加拿大維多利亞醫療援華委員會、加拿大中國戰災救濟委員會等組織同保盟重建了合作聯繫。同時，保盟還經常和中外救濟聯合組織駐重慶的辦事處保持正常聯繫，並與駐重慶的紐約美國援華會、紅十字會、醫療援華會的分支機構等建立了良好合作關係。

　　宋慶齡在重慶衝破國民黨的種種封鎖，領導保盟組織募捐，救濟難民、傷兵和兒童；組織物資，把大批的藥品、醫療器械和其它救援物資送到八路軍、新四軍及抗日根據地人民手中，並積極介紹和輸送外國醫生到抗日根據地工作。利用她特殊的身份將中國人民抗日的真實情況向國外報道，爭取援助。主要是給抗日民主根據地軍民募集捐款和醫療器材，重點是國際和平醫院。據不完全統計，保盟歷年給國際和平醫院的捐款為：「1942年，75000美元；1943年，54000多美元；1944年，12500多美元和4710000多元法幣；1945年，510000多美元和166000000多元法幣。」(重慶《大公報》1940年5月2日)這些捐款是根據地國際和平醫院的基本經費。此外，保盟還向根據地提供了大量物資，包括醫療設備。1943年6月，保盟向國際和平醫院運送了一批外科手術器械和磺胺藥品。

　　宋慶齡在重慶領導保盟，對延安醫科大學、晉東南延安醫大分部、冀西的白求恩醫學院、陝甘寧邊區的西北製藥廠，延安合作藥廠、延安洛杉磯孤兒院、抗日軍政大學、魯迅藝術學院、延安技術學校等許多單位提供長期援助。

　　宋慶齡在重慶不僅力求從國外獲得援助，而且還克服困難，舉辦多次義演、義賣、義賽等活動，籌集資金來援助難民、難童和貧困作家。在募捐活動中，宋慶齡常用她的戒指圖章在捐助者的收據上簽名蓋章。由於她的高尚品格，使得許多國內外人士都以能得到她的親自簽名蓋章為榮而踴躍參加捐款。

　　1945年12月，宋慶齡及保盟總部由重慶遷往上海，更名為「中國福利基金會」，後改稱「中國福利會」至今。