關於努爾哈赤的姓氏，文獻記載，稗官野史，雜說紛紜，莫衷一是，成為一團難解的歷史之謎。據文獻記載就有七種說法：認為努爾哈赤姓佟、童、仝、崔、雀、覺羅、愛新覺羅。

　　清太祖努爾哈赤姓什麼?正史和民間有諸多說法，這給清太祖蒙上了一層神秘的面紗。據文獻記載就有七種說法：伶、童、仝、崔、雀、覺羅、愛新覺羅。

　　滿學專家閻崇年教授考證大量史學資料，試解努爾哈赤姓氏之謎。他認為努爾哈赤的姓氏之所以雜說紛紜的原因，在於滿洲開始沒有文字，沒能留下原始的滿洲文獻記載;此外，清朝編修《明史》，凡是對清朝皇室祖先不利的史實或被刪除、或被篡改，使得史書中缺少記載。而《清太祖實錄》則編一些奇異的神話，來隱瞞歷史的真相。

　　據《清太祖實錄》開篇中稱：努爾哈赤姓愛新覺羅，並托之神意，公然宣稱「受姓于天」。這其中還有一個美麗的傳說，三位仙女自天而降，來到布爾瑚湖。湖泊景色秀美，湖水澄碧，清波蕩漾，四周林木蔥鬱，百鳥婉轉鳴唱，美景使三姐妹忘情，於是脫衣於地中。許久，三姐妹浴畢上岸。這時，一隻神鵲飛來，盤旋在三姐妹的頭上，輕盈可愛。三姐妹頻頻抬頭觀望。突然，神鵲將口中一顆紅色的果子丟在三妹佛庫倫的衣服上，紅果色澤艷麗，鮮嫩散香，佛庫倫愛不釋手，放到地上恐其污穢，捧到手裡無法穿衣，於是，她便含到了口裡。不料，紅果剛剛放到口中，竟順勢滑到腹內。頓時，佛庫倫感到腹部沉重，不知過了多久，佛庫倫生下一個男孩。孩子落地能言，身高體壯。十幾個春秋過後，即長成一個相貌英俊、舉止非凡的奇男子。佛庫倫給兒子講述了這段離奇的身世，命其以愛新覺羅為姓，名布庫裡雍順。

　　布庫裡雍順也就是清朝皇帝的祖先，自《清太祖實錄》之後，官修的《會典》、《宗譜》、《通志》等，凡屬清代的官書，以及來自努爾哈赤及其後裔一方的記載，都眾口一詞地肯定：自己是姓「愛新覺羅」的。

　　但是對照來自於明朝、朝鮮的官私書籍，則明明白白地寫著清太祖努爾哈赤姓佟，比如《明神宗實錄》萬曆十七年(1589)九月記載：「以建州夷酋佟奴爾哈赤為都督僉事。」陳建輯、沈國元訂《皇明從信錄》記載：「奴爾哈赤佟姓，故建州枝部也。」而且朝鮮文獻也留下了這樣的記載。申忠一的《建州紀程圖記》中載：萬曆二十四年(1596)正月，努爾哈赤向朝鮮國王回帖：「女真國建州衛管束夷人之主佟奴爾哈赤稟」等等。努爾哈赤自稱姓佟。朝鮮南部主簿申忠一到達佛阿拉時，受到過努爾哈赤的接見，並在那裡住了一段時間。他回國後將見聞寫成《申忠一書啟及圖錄》即《建州紀程圖記》，因此資料相當可信;而上面所講的《回帖》正是努爾哈赤本人讓他轉給朝鮮國王的。既然是努爾哈赤親自審閱過的正式公文，應當算是第一手資料。不過，應該引起注意的是，朝鮮文獻更多的是把「佟」寫作「童」。

　　近年來出版的《清肇祖傳》對努爾哈赤先世家族的事跡進行了研討。該研究成果認為：努爾哈赤的先世出自建州女真，明朝設建州左衛安置他們。努爾哈赤先世家族譜牒，主要是以八世祖范嗏為核心而形成的童氏三家族的譜系與事跡。該書認為努爾哈赤八世祖范嗏，姓夾溫氏，漢姓為童。夾溫就是金代的夾谷，《金史·國語解》：「夾谷[漢姓]曰仝。」仝為同的古體字，姓氏往往寫作童或佟。後世努爾哈赤承此姓，初為佟，後改姓愛新覺羅。愛新，滿語為aisin，金也，此「金」據著名清史學家孟森考證即是「加溫」的合音。夾溫是金代胡裡改路貴戚姓氏的沿襲，胡裡改路沿所在牡丹江口，努爾哈赤的先世在金代居住在牡丹江口時，可能是貴戚，所以授賜夾谷氏。

　　根據閻崇年的說法，伶姓或童姓，不但是遼東的顯著大姓，也是當時女真人的普遍姓氏。誰做了部落的酋長，誰與明朝發生關係，這人便以佟或童為姓。

　　除了以上「愛新覺羅」、「童」、「佟」、「仝」等幾種說法外，閻崇年認為，朝鮮方面還有一種「雀」、「崔」說。這兩個姓氏則來源於仙女吞服神鵲(雀)留下的果子，而生下清朝皇帝祖先布庫裡雍順的神話。而認為努爾哈赤姓「崔」是由於朝鮮語中，崔的發音介乎於漢語缺和吹之間，與「覺羅」中「覺」字音相近，於是懷疑崔姓可能是來源於「覺羅」的誤讀。

　　那麼覺羅說的立論根據是什麼呢?專家指出，早在金代女真人中就有交魯氏。交魯，即覺羅。女真人每遷至新地常在原來姓氏上加個新地名而成新的姓氏。覺羅氏居愛新水(牡丹江)者，稱愛新覺羅氏。此外，研究表明「覺羅」姓同「肅慎，稷慎，息慎，女真」等族稱和「哈拉」(姓)具有同源關係，它們都來源於「箭" kuru以及它的派生形式。著名滿學專家金啟孮先生在《愛新覺羅姓氏之謎》一文中在批駁了愛新覺羅姓氏是趙宗後裔之說的同時，也明確地指出：「愛新覺羅、伊爾根覺羅、西林覺羅、舒舒覺羅、通顏覺羅、阿哈覺羅等覺羅氏，實即金代的交魯氏。」

　　《清朝通志·氏族略》裡記載愛新覺羅是國姓，愛新是金的意思。其他的覺羅則冠以地名、部名、民名等，與國姓相區別，以表示它們和愛新覺羅是有所分別的。在《八旗滿洲氏族通譜》裡，記載有八種覺羅，伊爾根覺羅、舒舒覺羅、西林覺羅、通顏覺羅、阿顏覺羅、呼倫覺羅、阿哈覺羅、察喇覺羅。可見「覺羅」是滿洲皇室舊有的姓氏，「愛新」是後來加添的，其目的在於顯示帝王后裔的尊貴。

　　既然「愛新」有「金」的意思，一些學者就認為努爾哈赤的真實姓氏是金，猛哥帖木兒是努爾哈赤的六世祖，有史料記載他姓金，所以，猛哥帖木兒及其後裔努爾哈赤都姓金，也就是姓愛新。「定姓為『愛新覺羅』的目的無非一個，就是附會自己是前朝金代的皇族後裔，以此來說明自己家族血統的高貴，借此標榜自己的祖先來歷不凡。」

　　正如閻崇年所說的：伶姓畢竟是漢人的姓氏，在和明朝官方文書往來時方便些，但是金姓卻是金朝女真的國號，不但可以自顯是帝王種族的後裔，而且可以憑藉著它在女真民族中有所號召。因此，「愛新覺羅」這個姓就有其產生的原因和形成的過程了。

　　清太祖努爾哈赤的姓氏——愛新覺羅，由於沒有找到直接的史料依據，而是學者根據史料推論，所以其演變過程至今仍是一個歷史之謎。