在辛亥之際的歷史轉型中，黃興是孫中山的最佳配角，他是一個具有強烈配角意識的歷史人物，從未想要取代孫中山。雖然他有這樣的機會，也有這樣的威望與實力。但他認為革命「不能有絲毫私意、私見、私利、私圖」，當有人請求他取代孫中山時，黃興卻決然表示，「革命為黨眾生死問題，而非個人名位問題，孫總理德高望重，諸君如求革命得有成功，乞勿誤會，而傾心擁護，且免陷興於不義。」

　　但就是這一對親密戰友，在辛亥革命前卻差點關係破裂。事情緣於為選用民國國旗而起爭執。

　　1905年7月，黃興在日本結識孫中山，並和孫中山共同組建了中國同盟會。據《章太炎自定年譜》和馮自由《革命逸史》(初集)記載，1906年，同盟會集會研究革命方略，並討論日後所用的中華民國國旗。孫中山主張用他的鄉賢、已犧牲的戰友陸皓東設計的青天白日旗。但黃興卻對此持反對意見，他覺得青天白日旗設計不美，而且和日本太陽旗又相近似。孫中山於是稍稍作了讓步，提出旗子可改作紅藍白三色，這樣既符合自由、平等、博愛的真義，又增添美觀。不料黃興還是不予接受。甚至大怒，誓言要脫離同盟會。這是辛亥革命以前孫、黃最大的一次分歧。

　　顧全大局———這是黃興身上一個突出的亮點，也是他鮮明的革命性的體現。這一點，在他兢兢業業輔助孫中山從事革命事業上，尤為明顯。對此，我們只要將歷史上兩次「倒孫」事件重新梳理一下，便可知曉。

　　第一次「倒孫」事件發生於1907年3月4日，當時章太炎、張繼、陶成章等人就潮州、惠州等地起義失敗和孫中山分配贈款一事，要求罷免孫中山同盟會總理職務，改選黃興為總理。

　　黃興則決然表示，「革命為黨眾生死問題，而非個人名位問題，孫總理德高望重，諸君如求革命得有成功，乞勿誤會，而傾心擁護，且免陷興於不義。」

　　不要陷我黃興於不義——一個「義」字，就像一面高高飄揚的友善的旗幟，拂去了一片甚囂塵上的「倒孫」聒噪。

　　第二次「倒孫」事件發生在1909年秋天，同盟會會員陶成章和李燮和等人代表七省同志在南洋起草了所謂的《孫文罪狀》，要求開會改選同盟會總理。黃興竭力抵制，還寫信為孫中山辯誣，並親臨南洋平息那裡的反孫情緒。黃興又一次舉起了友善的旗幟，來化解同志間的矛盾。黃興逝世後，章太炎書輓聯曰：「無公(黃興)則無民國;有史必有斯人」。

　　對此，黃興本人說得很透徹：「太平天國起初節節勝利，發展很快，但因幾個領袖互爭權利，終至失敗。我們要引為鑒戒。肯自我犧牲的人才能從事革命。革命同志最要緊的是團結一致，才有力量打擊敵人。要團結一致，就必須不計較個人的權利，互相推讓。」

　　黃興的歷史地位被降低，有學者認為，主要緣於1913年討伐袁世凱的「二次革命」失敗後，他與孫中山之間的激烈爭論。1913年3月20日，國民黨代理理事長宋教仁在上海被袁世凱指使的刺客暗殺。黃興主張依靠法律解決「宋案」，孫中山則主張依靠武力，二人各不退讓。不久，「二次革命」迅速失敗，大部分骨幹亡命日本。孫中山在總結失敗原因時，強調了革命黨人的主觀因素：一是不服從，二是不統一，尤其是「不肯服從一個領袖的命令」，著重提到了黃興。在日本，黃興去見孫中山，遭到痛罵。兩人關係出現裂痕。之後，他們又在建黨問題上意見相反，爭論激烈。據說，當時二人感情激昂，「時聲高驚四壁」。晚餐後又激烈爭論，「深夜未盡，不歡而散」。而在此過程中，同為孫中山左膀右臂的辛亥革命早期革命家陳其美，毫無保留地站在孫中山一邊，黃興被孤立。1914年6月，黃興致函孫中山，作最後「忠告」，孫中山則復函，勸其「靜養兩年」。1914年，黃興離日旅居美國。袁世凱死後，他於1916年7月回到上海，同孫中山恢復了往日的親密，但卻於10月31日在上海病逝，享年42歲。