斑馬身體上的黑白斑紋被認為是一種偽裝，但科學家最新研究發現，蒼蠅很難落在斑馬的黑白斑紋上，斑紋對於驅趕蒼蠅非常有效。

斑紋可作為偽裝，使斑馬在不斷變化的叢林光線中不被發現，這種偽裝隱蔽性是非常重要的，斑馬多數時間是在野外度過。

而另一個主流理論認為，斑馬會使掠食者感到眩目，因此很難判斷斑馬的體型和速度。
其它理論認為，斑紋對於非洲炎炎烈日可起到降溫的作用，同時也是一種有效識別彼此的方式，與其它種群混合在一起很容易找到同伴。

然而最新研究指出，斑馬身體黑白斑紋間隔與蒼蠅叮叮咬的重合位置密切相關，斑馬身體毛髮較短、缺少冬季皮毛層可能易被叮咬，因此需要額外的保護措施，斑馬可能易受攜帶疾病的蒼蠅攻擊。