多爾袞頒頒布"留發不留頭"的嚴厲剃頭令後，不僅遭到了傳統知識分子的抵制，也激怒了下層民眾。剃髮對當時的漢人而言，心理上是難以承受的。"身體髮膚授之父母，不可損傷"，這是千年以來的倫理觀，也是一種根深蒂固的思維方式。剃髮不僅有違傳統，也是一種侮辱。於是，本已逐漸平靜的江南又騷動起來了。
七月初一，嘉定當地的平民百姓集合了十幾萬人，舉旗反對剃髮。原先反明投清的叛將李成棟被派往鎮壓。一開戰，李以騎兵衝擊，鄉兵即四散奔走，自相踐踏，被打得落花流水，大敗而回。初四嘉定城破，李成棟下令屠城，放部下大肆劫掠屠戮，大屠殺持續了一日，約三萬人遇害，嘉定城內"浮屍滿河，舟行無下篙處"。
殺戮的恐怖並未嚇倒民眾。李成棟一走，四散逃亡的民眾又再度聚集，一位名叫朱瑛的反清義士率五十人進城，糾集民眾，又一次控制了嘉定。李成棟遣部將徐元吉鎮壓，因嘉定居民聞風逃亡，這一次的目標主要是城郊，"數十里內，草木盡毀。積屍成丘，民間炊煙斷絕。"此為嘉定第二屠。
抵抗的餘波還在繼續。八月二十六日，綠營把總吳之藩造反，但很快就被覆平，李成棟惱怒，嘉定也再遭浩劫，連平息吳的造反外帶屠戮平民，嘉定城內外又有兩萬多人被殺。這是嘉定第三屠。
經過嘉定三屠，野蠻的血腥終於壓制住了反抗的餘波。李成棟因平定江南戰績卓著，被提拔為江南巡撫，不久又調往東南平定南明隆武朝。值得一提的是，當初李成棟降清之後，作為多鐸的先頭部隊，充當過攻打揚州的前驅，"揚州十日"他同樣有份兒。後來由於慾望得不到滿足，而永歷的許諾更有誘惑力，於是又反清而去，終被清軍所殺。
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